Die Entwicklung und Einf hrung von Next-Generation
Sequencing-Technologien ver ndern die M glichkeiten f r
Transkriptomstudien immens. Mit der Leistungsf higkeit der
momentanen Sequenziertechnologien k nnen Millionen von Sequenzen in
k rzester Zeit sequenziert werden. Mit PASSAGE wird in diesem Buch
ein Verfahren zur genomweiten Genexpressionsanalyse ohne ein
Referenzgenom vorgestellt. Neben der Analyse von Einzelzellen wird
aufgezeigt wie mit PASSAGE auch die Analyse von Metatranskriptomen
m glich ist. Ist ein Referenzgenom vorhanden so kann mit PASSAGE
der Aufwand der Betrachtung der einzelnen Sequenzen mit eben diesem
Verfahren deutlich reduziert werden. Neben der reinen Analyse der
Daten wird zudem eine grafische Benutzeroberfl che zur
Visualisierung der Ergebnisse vorgestellt. Damit wird dem Anwender
eine u erst effiziente Analyse der Daten erm glicht. Der Vergleich
mit Microarray-Ergebnissen zeigt die Validit t dieses Verfahrens
zur genomweiten Genexpressionsanalyse an Einzelzellen oder von
Metatranskriptomen.
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